Abstract

PEIGNIER, Sergio  and  CASTANETA M., Heriberto. BÚSQUEDA DE ESTRUCTURAS SECUNDARIAS ÓPTIMAS Y SUBÓPTIMAS DE UNA CADENA DE ARN UTILIZANDO INTELIGENCIA ARTIFICIAL. Rev. Bol. Quim [online]. 2012, vol.29, n.2, pp.147-157. ISSN 0250-5460.

El ácido ribonucleico (ARN) no puede existir en forma de cadena lineal, esta molécula se repliega para alcanzar su estructura más estable mediante la formación de puentes de hidrógeno. La descripción de estos puentes es llamada, estructura secundaria del ARN. A partir de ésta, es posible deducir su estructura terciaria del ARN. En muchos casos esta estructura terciaria otorga al ARN sus propiedades, entonces resulta interesante e importante conocer la estructura secundaria de las cadenas de ARN. Encontrar éstas estructuras mediante técnicas experimentales (cristalografía de rayos X) resulta lento y largo, por ende, resulta interesante predecir éstas estructuras mediante técnicas computacionales de predicción como ser Inteligencia Artificial. En el presente trabajo se ha utilizado una red neuronal de Hopfield para encontrar diferentes estructuras secundarias estables y una red neuronal multicapa unidireccional, entrenada con ejemplos biológicos reales, para elegir la estructura secundaria más próxima a una estructura "biológica" real entre las estructuras subóptimas encontradas por la red de Hopfield. Se realizó éste trabajo (entrenamiento de la segunda red, verificación de la capacidad de predicción y validación) gracias a varias muestras de micro-ARN de drosophilas. Mediante estas redes neuronales se ha logrado predecir una estructura secundaria de ARN cercana a la "real" para un micro-ARN de Drosophila Sosophora willistoni.

Keywords : RNA; Secondary Structure; Neural Network; Artificial Intelligence.

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