Revista Boliviana de Química

Claisen rearrangement of allyl vinyl ethers to afford alkenes, Part IV; mechanistic theoretical proposals; the organic chemistry notebook series, a Didactical approach, N° 12

This is the twelfth theoretical assay in the series: "The Organic Chemistry Notebook Series, a Didactical Approach". The aim of this series of studies is to help students to have a graphical view of organic synthesis reactions of diverse nature. We have taken a series of reactions compiled by W. Carruthers in 'Some modern methods of organic synthesis', and we have proposed didactical and mechanistic views for them. This theme is included in the chapter "Formation of carbon-carbon double bonds" in the mentioned text. In the present chapter we expose more Claisen rearrangements variations. The Claisen rearrangement can be regarded as a particular case of Cope's rearrangement, hence, on the basis of the structural theory and the known mechanisms of organic chemistry, we have proposed theoretical mechanisms for the synthesis of dienes from 2-methyl-3-phenyl-1,5-hexadiene at low temperature. We have proposed a mechanism for the synthesis of δԑ-unsaturated aldehydes and ketones through the oxy-Cope rearrangement of 1,5-hexadienes. We've described the mechanism for the key step of the synthesis of the sesquiterpene (±)-juvabione. The mechanistic views of the synthesis of the natural germacrane sesquiterpenes are proposed. We have proposed a mechanism for the thio Claisen rearrangement of allyl vinyl sulfides in the transformation into ƴδ5-unsaturated carbonyl compounds, for example the preparation of 4-tridicenal and the [2,3]sigmatropic rearrangement of allylsulphonium ylids like in the preparation of y-cyclocitral.

Reordenamiento de Claisen de éteres alíl vinílicos para dar alquenos: parte IV; propuestas mecanicistas teóricas; serie el cuaderno de química orgánica, un enfoque didáctico, N°12. Este es el duodécimo ensayo teórico en la serie: "El cuaderno de química orgánica, un enfoque didáctico". El objetivo de esta serie de estudios es ayudar a los estudiantes a disponer de una visión gráfica de reacciones de síntesis orgánicas de diversa naturaleza. Hemos tomado una serie de reacciones compiladas por W. Carruthers en: 'Some modern methods of organic synthesis', para las cuales hemos propuesto vistas mecanicistas y didácticas. Este tema está incluido en el capítulo "Formation of carbón-carbón double bonds" del mencionado texto. En el presente capítulo exponemos más variaciones del reordenamiento de Claisen. El reordenamiento de Claisen puede ser considerado como un caso particular del reordenamiento de Cope, por lo tanto, hemos propuesto mecanismos teóricos basados en la teoría estructural y los mecanismos conocidos de la química orgánica, para la síntesis de dienos a partir de 2-metil-3-fenil-1,5-hexadieno a bajas temperaturas. Hemos abordado por mecanismos la síntesis de aldehidos y cetonas insaturados en δԑ a través de transposiciones oxy-Cope de 1,5-hexadienos. Hemos descrito el mecanismo del paso clave de la síntesis del sesquiterpeno (±)-juvabione. Las vistas mecanicistas de la síntesis de los productos naturales sesquiterpenos del germacrane se hallan propuestas. Hemos propuesto un mecanismo para la transposición del tipo tio-Claisen de sulfuras de alilivinilo en la transformación en compuestos carbonilo ƴδ-insaturados, como la preparación del 4-tridecenal y el reordenamiento [2,3]-sigmatrópico de ilidos alilsulfonios como en la preparación de y-ciclocitral.

Análisis bioinformático de Arn-Seq con una perspectiva para Bolivia

ABSTRACT RNA-seq has become the tool of choice for transcriptome studies. Transcriptome provides key information about global changes of an organism under certain conditions at a determined moment. Next-Generation Sequencing technology has made transcriptomic studies available for everyone, increasing the demands of researchers within the bioinformatic field. Therefore, in the present review we are describing the bioinformatics workflow, analysis and applications of RNA-seq. At the same time, we want to present a computing cluster capable to perform bioinformatic analysis placed in Bolivia, known as CnCaBo.

RESUMEN Spanish title: Análisis bioinformático de ARN-SEQ con una perspectiva para Bolivia. RNA-seq se ha convertido en la herramienta más utilizada para el estudio de transcriptomas. El transcriptoma nos provee información clave sobre los cambios globales de un organismo bajos ciertas condiciones en un determinado momento. Las nuevas tecnologías de secuenciación masiva han permitido que la investigación en el área de la transcriptómica esté al alcance de todos, incrementando la demanda de investigadores en el área de la bioinformática. Es por eso que el presente artículo de revisión pretende contribuir al conocimiento del análisis bioinformático de transcriptómica mediante RNA-seq y sus aplicaciones. Al mismo tiempo queremos dar a conocer la implementación de un clúster computacional para realizar análisis bioinformáticos localizado en Bolivia denominado CnCaBo

Evaluación del grado de contaminación por petróleo en aguas de la bahía de santiago de cuba

The bay of Santiago de Cuba is considered by stock market because of its configuration, which presents a narrow entrance channel that limits the renewal of its waters, favoring pollution processes. The main objective of the investigation is the determination of the presence of hydrocarbons in the bay water, using methods of physical-chemical analysis. For the development of the experimental part, samples of sea water were taken at selected points ("Guillermón Moneada" Port, "La Estrella" Beach and Oxidation Lagoon Zone of the "Hermanos Díaz" refinery). The methods of spectrophotometry and surface tensión were applied. The obtained valúes were evaluated and compared with results of previous studies, demonstrating results of contamination by hydrocarbons in the study área.

Spanish title: Determinación de contaminación por Hidrocarburos en la bahía de Santiago de Cuba. La bahía de Santiago de Cuba es considerada de bolsa por su configuración, la cual presenta un estrecho canal de entrada que limita la renovación de sus aguas, favoreciendo los procesos de contaminación. El objetivo principal de esta investigación es la determinación de la presencia de hidrocarburos en el agua de la bahía, utilizando métodos de análisis físico-químicos. Para el desarrollo de la parte experimental se tomaron muestras de agua de mar en puntos seleccionados de la misma (Puerto "Guillermón Moneada", Playa "La Estrella" y Zona de laguna de oxidación de la refinería "Hermanos Díaz"). Se aplicaron los métodos de espectrofotometría y tensión superficial. Fueron evaluados los valores obtenidos y se comparó con resultados de estudios precedentes, demostrándose resultados de contaminación por hidrocarburos en la zona de estudio.